Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2BP42772 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms