Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXD10P28358 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD10P28358 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms