Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFNA1P20827 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA1P20827 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA1P20827 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms