Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB3P05106 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB3P05106 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms