Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TK1P04183 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TK1P04183 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TK1P04183 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TK1P04183 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TK1P04183 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TK1P04183 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TK1P04183 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TK1P04183 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TK1P04183 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TK1P04183 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TK1P04183 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TK1P04183 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TK1P04183 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TK1P04183 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TK1P04183 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TK1P04183 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TK1P04183 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TK1P04183 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TK1P04183 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TK1P04183 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TK1P04183 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TK1P04183 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TK1P04183 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TK1P04183 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TK1P04183 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TK1P04183 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TK1P04183 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TK1P04183 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TK1P04183 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TK1P04183 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TK1P04183 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TK1P04183 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TK1P04183 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TK1P04183 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TK1P04183 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TK1P04183 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TK1P04183 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TK1P04183 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TK1P04183 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TK1P04183 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TK1P04183 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TK1P04183 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TK1P04183 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TK1P04183 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TK1P04183 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TK1P04183 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TK1P04183 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TK1P04183 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TK1P04183 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TK1P04183 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TK1P04183 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TK1P04183 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TK1P04183 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TK1P04183 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TK1P04183 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TK1P04183 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TK1P04183 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TK1P04183 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TK1P04183 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TK1P04183 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TK1P04183 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TK1P04183 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TK1P04183 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TK1P04183 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TK1P04183 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TK1P04183 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms