Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KRW8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KRW8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KRW8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KRW8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KRW8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KRW8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KRW8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KRW8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KRW8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KRW8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KRW8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KRW8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KRW8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KRW8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KRW8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KRW8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KRW8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KRW8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3KRW8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KRW8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KRW8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KRW8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KRW8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KRW8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KRW8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KRW8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KRW8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KRW8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KRW8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KRW8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KRW8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KRW8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KRW8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KRW8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KRW8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KRW8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KRW8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KRW8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KRW8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KRW8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KRW8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3KRW8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3KRW8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3KRW8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3KRW8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3KRW8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3KRW8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3KRW8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3KRW8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3KRW8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3KRW8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3KRW8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
J3KRW8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
J3KRW8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
J3KRW8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3KRW8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3KRW8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
J3KRW8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3KRW8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3KRW8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
J3KRW8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3KRW8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3KRW8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3KRW8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3KRW8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3KRW8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3KRW8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3KRW8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3KRW8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3KRW8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3KRW8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
J3KRW8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3KRW8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3KRW8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3KRW8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3KRW8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3KRW8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3KRW8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KRW8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KRW8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KRW8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KRW8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KRW8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KRW8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KRW8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KRW8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KRW8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KRW8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KRW8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KRW8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KRW8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KRW8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KRW8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KRW8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KRW8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3KRW8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
J3KRW8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
J3KRW8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
J3KRW8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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