Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF3BA8MYP8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms