Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVD1

FAM237B, Family with sequence similarity 237 member B, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM237BA0A1B0GVD1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM237BA0A1B0GVD1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM237BA0A1B0GVD1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM237BA0A1B0GVD1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM237BA0A1B0GVD1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM237BA0A1B0GVD1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM237BA0A1B0GVD1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM237BA0A1B0GVD1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM237BA0A1B0GVD1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM237BA0A1B0GVD1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM237BA0A1B0GVD1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM237BA0A1B0GVD1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM237BA0A1B0GVD1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM237BA0A1B0GVD1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM237BA0A1B0GVD1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM237BA0A1B0GVD1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM237BA0A1B0GVD1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM237BA0A1B0GVD1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM237BA0A1B0GVD1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.1 ms