Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL1Q9UKG1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms