Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CDK12Q9NYV4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDK12Q9NYV4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms