Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZDHHC3Q9NYG2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC3Q9NYG2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms