Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDAP2Q9NXN4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GDAP2Q9NXN4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDAP2Q9NXN4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms