Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NECAP2Q9NVZ3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms