Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EBF4Q9BQW3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF4Q9BQW3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms