Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEC16BQ96JE7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC16BQ96JE7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms