Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
NXNL1Q96CM4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXNL1Q96CM4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms