Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWT9

SLC13A3, Solute carrier family 13 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3Q8WWT9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A3Q8WWT9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A3Q8WWT9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.8 ms