Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE82

SH3TC1, SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3TC1Q8TE82 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH3TC1Q8TE82 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SH3TC1Q8TE82 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms