Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3W7

SCYL2, SCY1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCYL2Q6P3W7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SCYL2Q6P3W7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCYL2Q6P3W7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms