Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRRT3Q5FWE3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT3Q5FWE3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
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