Protein–RNA interactions for Protein: Q53S58

TMEM177, Transmembrane protein 177, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM177Q53S58 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM177Q53S58 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM177Q53S58 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms