Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
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COL24A1Q17RW2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL24A1Q17RW2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
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COL24A1Q17RW2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
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COL24A1Q17RW2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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COL24A1Q17RW2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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COL24A1Q17RW2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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COL24A1Q17RW2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
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COL24A1Q17RW2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
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COL24A1Q17RW2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
COL24A1Q17RW2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL24A1Q17RW2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
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