Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFTN1Q14699 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
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