Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KLF9Q13886 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF9Q13886 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms