Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPIRE1Q08AE8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPIRE1Q08AE8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPIRE1Q08AE8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms