Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REG1BP48304 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REG1BP48304 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REG1BP48304 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REG1BP48304 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
REG1BP48304 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REG1BP48304 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
REG1BP48304 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
REG1BP48304 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
REG1BP48304 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
REG1BP48304 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
REG1BP48304 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REG1BP48304 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REG1BP48304 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
REG1BP48304 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REG1BP48304 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
REG1BP48304 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REG1BP48304 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
REG1BP48304 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
REG1BP48304 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
REG1BP48304 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
REG1BP48304 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
REG1BP48304 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
REG1BP48304 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
REG1BP48304 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
REG1BP48304 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
REG1BP48304 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
REG1BP48304 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
REG1BP48304 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
REG1BP48304 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
REG1BP48304 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
REG1BP48304 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
REG1BP48304 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
REG1BP48304 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
REG1BP48304 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
REG1BP48304 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
REG1BP48304 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
REG1BP48304 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REG1BP48304 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REG1BP48304 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REG1BP48304 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REG1BP48304 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
REG1BP48304 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REG1BP48304 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REG1BP48304 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
REG1BP48304 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
REG1BP48304 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
REG1BP48304 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
REG1BP48304 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
REG1BP48304 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
REG1BP48304 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
REG1BP48304 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
REG1BP48304 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
REG1BP48304 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
REG1BP48304 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
REG1BP48304 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
REG1BP48304 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
REG1BP48304 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
REG1BP48304 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
REG1BP48304 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
REG1BP48304 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
REG1BP48304 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
REG1BP48304 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
REG1BP48304 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
REG1BP48304 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
REG1BP48304 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
REG1BP48304 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
REG1BP48304 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
REG1BP48304 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
REG1BP48304 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
REG1BP48304 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
REG1BP48304 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
REG1BP48304 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
REG1BP48304 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
REG1BP48304 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
REG1BP48304 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
REG1BP48304 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
REG1BP48304 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
REG1BP48304 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
REG1BP48304 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
REG1BP48304 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
REG1BP48304 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
REG1BP48304 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
REG1BP48304 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
REG1BP48304 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
REG1BP48304 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
REG1BP48304 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
REG1BP48304 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
REG1BP48304 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
REG1BP48304 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
REG1BP48304 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REG1BP48304 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REG1BP48304 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
REG1BP48304 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
REG1BP48304 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REG1BP48304 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REG1BP48304 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REG1BP48304 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REG1BP48304 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
REG1BP48304 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms