Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 BNA1YJR025C 534 nt4.23□□□□□ -1.73
SEC28P40509 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt4.23□□□□□ -1.73
SEC28P40509 YMR130WYMR130W 909 nt4.23□□□□□ -1.73
SEC28P40509 PRX1YBL064C 786 nt4.23□□□□□ -1.73
SEC28P40509 YBL081WYBL081W 1107 nt4.23□□□□□ -1.73
SEC28P40509 RRP40YOL142W 723 nt4.23□□□□□ -1.73
SEC28P40509 RAD17YOR368W 1206 nt4.23□□□□□ -1.73
SEC28P40509 YOR379CYOR379C 339 nt4.23□□□□□ -1.73
SEC28P40509 TRS85YDR108W 2097 nt4.23□□□□□ -1.73
SEC28P40509 RPG1YBR079C 2895 nt4.23□□□□□ -1.73
SEC28P40509 PAF1YBR279W 1338 nt4.22□□□□□ -1.73
SEC28P40509 DIN7YDR263C 1293 nt4.22□□□□□ -1.73
SEC28P40509 PIC2YER053C 903 nt4.22□□□□□ -1.73
SEC28P40509 YGL088WYGL088W 366 nt4.22□□□□□ -1.73
SEC28P40509 YGL101WYGL101W 648 nt4.22□□□□□ -1.73
SEC28P40509 SPO16YHR153C 597 nt4.22□□□□□ -1.73
SEC28P40509 YJL218WYJL218W 591 nt4.22□□□□□ -1.73
SEC28P40509 CNB1YKL190W 528 nt4.22□□□□□ -1.73
SEC28P40509 GAT3YLR013W 426 nt4.22□□□□□ -1.73
SEC28P40509 SPC24YMR117C 642 nt4.22□□□□□ -1.73
SEC28P40509 EOS1YNL080C 1101 nt4.22□□□□□ -1.73
SEC28P40509 DIP2YLR129W 2832 nt4.22□□□□□ -1.73
SEC28P40509 CLB5YPR120C 1308 nt4.21□□□□□ -1.73
SEC28P40509 FAR10YLR238W 1437 nt4.21□□□□□ -1.73
SEC28P40509 MCM21YDR318W 1107 nt4.21□□□□□ -1.74
SEC28P40509 COS8YHL048W 1146 nt4.21□□□□□ -1.74
SEC28P40509 EFB1YAL003W 621 nt4.21□□□□□ -1.74
SEC28P40509 YJL028WYJL028W 336 nt4.21□□□□□ -1.74
SEC28P40509 AIM22YJL046W 1230 nt4.21□□□□□ -1.74
SEC28P40509 ACP1YKL192C 378 nt4.21□□□□□ -1.74
SEC28P40509 SUI1YNL244C 327 nt4.21□□□□□ -1.74
SEC28P40509 FRM2YCL026C-A 582 nt4.21□□□□□ -1.74
SEC28P40509 PBN1YCL052C 1251 nt4.21□□□□□ -1.74
SEC28P40509 POL31YJR006W 1464 nt4.21□□□□□ -1.74
SEC28P40509 POL1YNL102W 4407 nt4.21□□□□□ -1.74
SEC28P40509 YOL153CYOL153C 1746 nt4.21□□□□□ -1.74
SEC28P40509 TRM11YOL124C 1302 nt4.21□□□□□ -1.74
SEC28P40509 SDT1YGL224C 843 nt4.2□□□□□ -1.74
SEC28P40509 YIL089WYIL089W 618 nt4.2□□□□□ -1.74
SEC28P40509 POC4YPL144W 447 nt4.2□□□□□ -1.74
SEC28P40509 SPC105YGL093W 2754 nt4.2□□□□□ -1.74
SEC28P40509 PUB1YNL016W 1362 nt4.19□□□□□ -1.74
SEC28P40509 OCA4YCR095C 1089 nt4.19□□□□□ -1.74
SEC28P40509 RXT3YDL076C 885 nt4.19□□□□□ -1.74
SEC28P40509 HIS6YIL020C 786 nt4.19□□□□□ -1.74
SEC28P40509 RDN5-1RDN5-1 121 nt4.19□□□□□ -1.74
SEC28P40509 RDN5-6RDN5-6 121 nt4.19□□□□□ -1.74
SEC28P40509 YMR084WYMR084W 789 nt4.19□□□□□ -1.74
SEC28P40509 VPS68YOL129W 555 nt4.19□□□□□ -1.74
SEC28P40509 MED7YOL135C 669 nt4.19□□□□□ -1.74
SEC28P40509 FOX2YKR009C 2703 nt4.19□□□□□ -1.74
SEC28P40509 AIM21YIR003W 2040 nt4.19□□□□□ -1.74
SEC28P40509 VPS45YGL095C 1734 nt4.18□□□□□ -1.74
SEC28P40509 TAF7YMR227C 1773 nt4.18□□□□□ -1.74
SEC28P40509 MED2YDL005C 1296 nt4.18□□□□□ -1.74
SEC28P40509 YHI9YHR029C 885 nt4.18□□□□□ -1.74
SEC28P40509 YAL065CYAL065C 387 nt4.18□□□□□ -1.74
SEC28P40509 YML031C-AYML031C-A 336 nt4.18□□□□□ -1.74
SEC28P40509 YML053CYML053C 639 nt4.18□□□□□ -1.74
SEC28P40509 SHE1YBL031W 1017 nt4.18□□□□□ -1.74
SEC28P40509 RPS19AYOL121C 435 nt4.18□□□□□ -1.74
SEC28P40509 YOL075CYOL075C 3885 nt4.18□□□□□ -1.74
SEC28P40509 GDH2YDL215C 3279 nt4.18□□□□□ -1.74
SEC28P40509 GEM1YAL048C 1989 nt4.18□□□□□ -1.74
SEC28P40509 HMS1YOR032C 1305 nt4.18□□□□□ -1.74
SEC28P40509 AIM14YGL160W 1713 nt4.18□□□□□ -1.74
SEC28P40509 LYP1YNL268W 1836 nt4.17□□□□□ -1.74
SEC28P40509 PEX21YGR239C 867 nt4.17□□□□□ -1.74
SEC28P40509 GVP36YIL041W 981 nt4.17□□□□□ -1.74
SEC28P40509 RSM25YIL093C 795 nt4.17□□□□□ -1.74
SEC28P40509 YBL059WYBL059W 582 nt4.17□□□□□ -1.74
SEC28P40509 SIW14YNL032W 846 nt4.17□□□□□ -1.74
SEC28P40509 PEP4YPL154C 1218 nt4.17□□□□□ -1.74
SEC28P40509 TIF5YPR041W 1218 nt4.17□□□□□ -1.74
SEC28P40509 VPS69YPR087W 321 nt4.17□□□□□ -1.74
SEC28P40509 TDA3YHR009C 1572 nt4.17□□□□□ -1.74
SEC28P40509 ABD1YBR236C 1311 nt4.17□□□□□ -1.74
SEC28P40509 MNR2YKL064W 2910 nt4.16□□□□□ -1.74
SEC28P40509 GCD1YOR260W 1737 nt4.16□□□□□ -1.74
SEC28P40509 RPC53YDL150W 1269 nt4.16□□□□□ -1.74
SEC28P40509 MSA2YKR077W 1092 nt4.16□□□□□ -1.74
SEC28P40509 PSF3YOL146W 585 nt4.16□□□□□ -1.74
SEC28P40509 CTR1YPR124W 1221 nt4.16□□□□□ -1.74
SEC28P40509 FLO8YER109C 2400 nt4.15□□□□□ -1.74
SEC28P40509 YNR065CYNR065C 3351 nt4.15□□□□□ -1.74
SEC28P40509 PTC1YDL006W 846 nt4.15□□□□□ -1.75
SEC28P40509 snR7-LsnR7-L 214 nt4.15□□□□□ -1.75
SEC28P40509 ARC15YIL062C 465 nt4.15□□□□□ -1.75
SEC28P40509 YAR023CYAR023C 540 nt4.15□□□□□ -1.75
SEC28P40509 HEK2YBL032W 1146 nt4.15□□□□□ -1.75
SEC28P40509 SPS4YOR313C 1017 nt4.15□□□□□ -1.75
SEC28P40509 EMP47YFL048C 1338 nt4.15□□□□□ -1.75
SEC28P40509 TAF8YML114C 1533 nt4.15□□□□□ -1.75
SEC28P40509 MSK1YNL073W 1731 nt4.15□□□□□ -1.75
SEC28P40509 VPS27YNR006W 1869 nt4.14□□□□□ -1.75
SEC28P40509 API2YDR525W 330 nt4.14□□□□□ -1.75
SEC28P40509 DUO1YGL061C 744 nt4.14□□□□□ -1.75
SEC28P40509 SOL4YGR248W 768 nt4.14□□□□□ -1.75
SEC28P40509 MCK1YNL307C 1128 nt4.14□□□□□ -1.75
SEC28P40509 IDH2YOR136W 1110 nt4.14□□□□□ -1.75
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