Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BMP3P12645 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BMP3P12645 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BMP3P12645 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BMP3P12645 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BMP3P12645 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
BMP3P12645 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BMP3P12645 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BMP3P12645 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BMP3P12645 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BMP3P12645 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BMP3P12645 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BMP3P12645 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BMP3P12645 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BMP3P12645 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BMP3P12645 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BMP3P12645 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BMP3P12645 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BMP3P12645 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BMP3P12645 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BMP3P12645 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BMP3P12645 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BMP3P12645 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BMP3P12645 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BMP3P12645 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BMP3P12645 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BMP3P12645 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BMP3P12645 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BMP3P12645 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BMP3P12645 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BMP3P12645 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BMP3P12645 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BMP3P12645 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BMP3P12645 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BMP3P12645 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BMP3P12645 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BMP3P12645 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BMP3P12645 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BMP3P12645 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BMP3P12645 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BMP3P12645 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BMP3P12645 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BMP3P12645 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BMP3P12645 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BMP3P12645 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BMP3P12645 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BMP3P12645 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BMP3P12645 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BMP3P12645 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BMP3P12645 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BMP3P12645 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BMP3P12645 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BMP3P12645 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BMP3P12645 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BMP3P12645 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BMP3P12645 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BMP3P12645 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BMP3P12645 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BMP3P12645 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BMP3P12645 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BMP3P12645 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BMP3P12645 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BMP3P12645 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BMP3P12645 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BMP3P12645 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BMP3P12645 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BMP3P12645 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BMP3P12645 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BMP3P12645 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BMP3P12645 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BMP3P12645 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BMP3P12645 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BMP3P12645 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BMP3P12645 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BMP3P12645 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BMP3P12645 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BMP3P12645 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BMP3P12645 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BMP3P12645 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BMP3P12645 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BMP3P12645 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BMP3P12645 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BMP3P12645 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BMP3P12645 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BMP3P12645 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BMP3P12645 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BMP3P12645 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BMP3P12645 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BMP3P12645 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BMP3P12645 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BMP3P12645 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BMP3P12645 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BMP3P12645 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BMP3P12645 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BMP3P12645 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BMP3P12645 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BMP3P12645 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BMP3P12645 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BMP3P12645 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BMP3P12645 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms