Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FCER1AP12319 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms