Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM4AO75164 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms