Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
IGSF3O75054 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms