Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LAD1O00515 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAD1O00515 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAD1O00515 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAD1O00515 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAD1O00515 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAD1O00515 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LAD1O00515 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAD1O00515 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAD1O00515 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAD1O00515 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAD1O00515 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAD1O00515 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAD1O00515 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAD1O00515 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAD1O00515 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAD1O00515 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAD1O00515 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAD1O00515 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAD1O00515 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAD1O00515 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAD1O00515 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LAD1O00515 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAD1O00515 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAD1O00515 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAD1O00515 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAD1O00515 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAD1O00515 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAD1O00515 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAD1O00515 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LAD1O00515 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAD1O00515 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAD1O00515 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAD1O00515 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAD1O00515 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LAD1O00515 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAD1O00515 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAD1O00515 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAD1O00515 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAD1O00515 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAD1O00515 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LAD1O00515 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAD1O00515 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAD1O00515 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAD1O00515 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAD1O00515 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAD1O00515 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAD1O00515 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAD1O00515 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAD1O00515 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAD1O00515 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAD1O00515 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAD1O00515 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAD1O00515 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAD1O00515 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAD1O00515 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAD1O00515 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAD1O00515 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAD1O00515 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAD1O00515 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAD1O00515 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAD1O00515 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAD1O00515 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAD1O00515 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAD1O00515 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAD1O00515 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAD1O00515 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAD1O00515 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAD1O00515 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAD1O00515 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAD1O00515 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAD1O00515 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAD1O00515 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAD1O00515 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAD1O00515 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAD1O00515 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LAD1O00515 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAD1O00515 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAD1O00515 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAD1O00515 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAD1O00515 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAD1O00515 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAD1O00515 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAD1O00515 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAD1O00515 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAD1O00515 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAD1O00515 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAD1O00515 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LAD1O00515 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAD1O00515 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAD1O00515 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAD1O00515 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAD1O00515 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAD1O00515 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAD1O00515 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAD1O00515 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAD1O00515 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAD1O00515 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAD1O00515 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAD1O00515 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms