Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF3BA8MYP8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms