Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC78A2IDD5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms