Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN79

SOX13, Transcription factor SOX-13, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX13Q9UN79 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX13Q9UN79 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX13Q9UN79 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.7 ms