Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK45

LSM7, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM7Q9UK45 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM7Q9UK45 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM7Q9UK45 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 326.1 ms