Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0B6

CCDC167, Coiled-coil domain-containing protein 167, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC167Q9P0B6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC167Q9P0B6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC167Q9P0B6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms