Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC29

NOD2, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD2Q9HC29 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD2Q9HC29 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NOD2Q9HC29 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOD2Q9HC29 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292.9 ms