Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.7 ms