Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PGBD1Q96JS3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGBD1Q96JS3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms