Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CKAP2LQ8IYA6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKAP2LQ8IYA6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms