Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR88Q6ZMY6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR88Q6ZMY6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms