Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PROX2Q3B8N5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROX2Q3B8N5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms