Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKOR2Q2VWA4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms