Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD1Q15797 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD1Q15797 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD1Q15797 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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