Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RAB35Q15286 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
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