Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SREBF2Q12772 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SREBF2Q12772 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
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