Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00205P59089 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00205P59089 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms