Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMD8P48556 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD8P48556 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms