Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BMP3P12645 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BMP3P12645 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BMP3P12645 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BMP3P12645 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BMP3P12645 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BMP3P12645 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BMP3P12645 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BMP3P12645 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BMP3P12645 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BMP3P12645 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BMP3P12645 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BMP3P12645 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BMP3P12645 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BMP3P12645 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BMP3P12645 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BMP3P12645 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BMP3P12645 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BMP3P12645 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BMP3P12645 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BMP3P12645 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BMP3P12645 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BMP3P12645 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BMP3P12645 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BMP3P12645 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BMP3P12645 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BMP3P12645 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BMP3P12645 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BMP3P12645 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BMP3P12645 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BMP3P12645 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BMP3P12645 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BMP3P12645 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BMP3P12645 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BMP3P12645 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
BMP3P12645 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BMP3P12645 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BMP3P12645 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BMP3P12645 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BMP3P12645 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BMP3P12645 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BMP3P12645 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BMP3P12645 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BMP3P12645 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BMP3P12645 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BMP3P12645 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BMP3P12645 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BMP3P12645 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BMP3P12645 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BMP3P12645 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BMP3P12645 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BMP3P12645 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BMP3P12645 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BMP3P12645 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BMP3P12645 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BMP3P12645 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BMP3P12645 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BMP3P12645 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BMP3P12645 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BMP3P12645 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BMP3P12645 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BMP3P12645 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BMP3P12645 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BMP3P12645 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BMP3P12645 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BMP3P12645 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BMP3P12645 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BMP3P12645 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BMP3P12645 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BMP3P12645 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BMP3P12645 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BMP3P12645 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BMP3P12645 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BMP3P12645 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BMP3P12645 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BMP3P12645 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BMP3P12645 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BMP3P12645 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BMP3P12645 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BMP3P12645 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BMP3P12645 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BMP3P12645 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BMP3P12645 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BMP3P12645 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BMP3P12645 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BMP3P12645 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BMP3P12645 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BMP3P12645 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BMP3P12645 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BMP3P12645 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BMP3P12645 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BMP3P12645 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BMP3P12645 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BMP3P12645 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BMP3P12645 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BMP3P12645 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BMP3P12645 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BMP3P12645 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BMP3P12645 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BMP3P12645 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms